生物質鍋爐跟一般鍋爐一樣，用的（de）時間長便會發生水垢。水垢的危害或是不容小視的，先是耗費（fèi）燃料（liào），降低鍋（guō）爐熱（rè）效率，鍋爐結有水垢時，使鍋（guō）爐受熱麵的導熱特點降低，燃料引（yǐn）燃所施放的熱值不能傳輸到鍋爐水中，許（xǔ）多的熱值被粉塵（chén）帶去，造成排風係統溫（wēn）度升高，排風係統熱危害提高，鍋爐的熱效率降低。

其次，傷害鍋爐安全係數運行，鍋爐水垢常常產生在熱負荷很高的鍋爐受熱表層。因水垢熱傳導特性很差（chà），導（dǎo）致（zhì）金屬複合材（cái）料壁厚一部分溫度（dù）極大（dà）地（dì）升高（gāo）。當溫度超（chāo）出了金屬所能擔負（fù）的允許溫度時。金（jīn）屬複合材料因過熱而應力鬆弛，抗拉強度降低，在鍋（guō）爐（lú）工作壓力下，金屬複合材料會發生起包，破孔和開裂（liè），傷害生物質鍋爐（lú）安全係數運行。而（ér）且（qiě）水垢會降低鍋爐負荷；鍋爐結垢後，由於傳熱性降低，要達鍋爐額定電流年降水量或額定（dìng）電流產熱值，務必（bì）多消耗燃料。但隨著著結垢厚薄的提（tí）高（gāo），以及爐內容量的井式爐占地麵積是固定不變（biàn）的，燃料消（xiāo）耗受（shòu）到限製，因此（cǐ）鍋（guō）爐的負荷便會降低。